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Last Updated :2024/06/15

Takumi Koshiba

Faculty of Science
Professor

Researcher information

■ Degree
  • Ph.D., Hokkaido University
■ Research Keyword
  • Mitochondria
  • ミトコンドリア
  • Cell Biology
  • Innate immunity
  • RNA virus
  • Protein Science
  • 生物物理学
  • タンパク質科学
■ Field Of Study
  • Life sciences, Nutrition and health science
  • Nanotechnology/Materials, Biochemistry
  • Life sciences, Medical biochemistry
  • Life sciences, Cell biology
  • Life sciences, Functional biochemistry
  • Life sciences, Biophysics
  • Nanotechnology/Materials, Molecular biochemistry

Career

■ Career
  • Apr. 2019 - Present
    Fukuoka University, Faculty of Science, Professor
  • Apr. 2007 - Mar. 2019
    Kyushu University, 大学院理学研究院 生物科学部門, Associate Professor
  • Apr. 2005 - Mar. 2007
    Kyushu University, 大学院理学研究院 生物科学部門, Assistant Professor
  • Apr. 2001 - Mar. 2005
    California Institute of Technology, Division of Biology, Postdoctoral Fellow
  • Jan. 2000 - Mar. 2002
    日本学術振興会特別研究員
■ Educational Background
  • Apr. 2001 - Mar. 2005
    California Institute of Technology, Biology, Postdoctoral Scholar
  • Apr. 1996 - Mar. 2001
    北海道大学大学院, 理学研究科, 生物科学専攻
  • Apr. 1992 - Mar. 1996
    Hokkaido University, School of Fisheries Sciences, 水産化学科
■ Member History
  • 2024 - Present
    代議員, 日本生化学会
  • 2022 - Present
    Frontiers in Immunology
  • 2022 - Present
    評議員, 日本ミトコンドリア学会
  • 2022 - Present
    評議員, 日本生化学会
  • 2021 - Present
    Editorial Board, Mitochondrial Communications
  • 2018 - Present
    Advisory Board members, The Journal of Biochemistry
  • 2017 - Present
    分野別専門委員, 日本生物物理学会
  • 2013
    役員等選挙実施委員, 日本生化学会

Research activity information

■ Award
  • Oct. 2012
    日本生化学会奨励賞
  • Jun. 2012
    第14回 花王研究奨励賞
  • May 2012
    日本生化学会九州支部学術奨励賞
  • Apr. 2012
    科学技術分野の文部科学大臣表彰・若手科学者賞
■ Paper
  • Mitochondrial reactive zones in antiviral innate immunity
    Yasukawa, K.; Koshiba, T.
    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects, 2021, Refereed
    Last
  • Mass spectrometry-based methods for analyzing the mitochondrial interactome in mammalian cells
    Koshiba, T.; Kosako, H.
    J. Biochem., 2020, Refereed
    Lead
  • MAVS is energized by Mff which senses mitochondrial metabolism via AMPK for acute antiviral immunity
    Hanada, Y.; Ishihara, N.; Wang, L.; Otera, H.; Ishihara, T.; Koshiba, T.; Mihara, K.; Ogawa, Y.; Nomura, M.
    Nature Communications, 2020, Refereed
  • Mitochondria – in the crossfire of SARS-CoV-2 and immunity
    Burtscher, J.; Cappellano, G.; Omori, A.; Koshiba, T.; Millet, G.P.
    iScience, 2020, Refereed
  • Influenza Virus-Induced Oxidized DNA Activates Inflammasomes.
    Moriyama, M.; Nagai, M.; Maruzuru, Y.; Koshiba, T.; Kawaguchi, Y.; Ichinohe, T.
    iScience, 2020, Refereed
  • The microRNAs miR-302b and miR-372 regulate mitochondrial metabolism via the SLC25A12 transporter, which controls MAVS-mediated antiviral innate immunity
    Yasukawa, K; Kinoshita, D; Yaku, K; Nakagawa, T; Koshiba, T
    J. Biol. Chem., 2020, Refereed
    Last
  • Influenza A virus M2 protein triggers mitochondrial DNA-mediated antiviral immune responses
    Moriyama, M; Koshiba, T; Ichinohe, T
    Nat. Commun., 2019, Refereed
  • Structural Basis of Mitochondrial Scaffolds by Prohibitin Complexes: Insight into a Role of the Coiled-Coil Region.
    Yoshinaka T; Kosako H; Yoshizumi T; Furukawa R; Hirano Y; Kuge O; Tamada T; Koshiba T
    iScience, 2019, Refereed
    Last
  • Two Conserved Amino Acids within the NSs of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Phlebovirus Are Essential for Anti-interferon Activity.
    Moriyama M; Igarashi M; Koshiba T; Irie T; Takada A; Ichinohe T
    J Virol., Sep. 2018, Refereed
  • Herpes Simplex Virus 1 VP22 Inhibits AIM2-Dependent Inflammasome Activation to Enable Efficient Viral Replication
    Yuhei Maruzuru; Takeshi Ichinohe; Ryota Sato; Kensuke Miyake; Tokuju Okano; Toshihiko Suzuki; Takumi Koshiba; Naoto Koyanagi; Shumpei Tsuda; Mizuki Watanabe; Jun Arii; Akihisa Kato; Yasushi Kawaguchi
    Cell Host and Microbe, 14 Feb. 2018, Refereed
  • RLR-mediated antiviral innate immunity requires oxidative phosphorylation activity
    Takuma Yoshizumi; Hiromi Imamura; Tomohiro Taku; Takahiro Kuroki; Atsushi Kawaguchi; Kaori Ishikawa; Kazuto Nakada; Takumi Koshiba
    SCIENTIFIC REPORTS, Jul. 2017, Refereed
    Last
  • The RNA- and TRIM25-Binding Domains of Influenza Virus NS1 Protein Are Essential for Suppression of NLRP3 Inflammasome-Mediated Interleukin-1β Secretion.
    Miyu Moriyama; I-Yin Chen; Atsushi Kawaguchi; Takumi Koshiba; Kyosuke Nagata; Haruko Takeyama; Hideki Hasegawa; Takeshi Ichinohe
    JOURNAL OF VIROLOGY, Apr. 2016, Refereed
  • Loss of Miro1-directed mitochondrial movement results in a novel murine model for neuron disease
    Tammy T. Nguyen; Sang S. Oh; David Weaver; Agnieszka Lewandowska; Dane Maxfield; Max-Hinderk Schuler; Nathan K. Smith; Jane Macfarlane; Gerald Saunders; Cheryl A. Palmer; Valentina Debattisti; Takumi Koshiba; Stefan Pulst; Eva L. Feldman; Gyoergy Hajnoczky; Janet M. Shaw
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Sep. 2014, Refereed
  • Influenza A virus protein PB1-F2 translocates into mitochondria via Tom40 channels and impairs innate immunity
    Takuma Yoshizumi; Takeshi Ichinohe; Osamu Sasaki; Hidenori Otera; Shun-ichiro Kawabata; Katsuyoshi Mihara; Takumi Koshiba
    NATURE COMMUNICATIONS, Aug. 2014, Refereed
    Last
  • Mitochondrial protein mitofusin 2 is required for NLRP3 inflammasome activation after RNA virus infection
    Takeshi Ichinohe; Tatsuya Yamazaki; Takumi Koshiba; Yusuke Yanagi
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, Oct. 2013, Refereed
  • A structural perspective of the MAVS-regulatory mechanism on the mitochondrial outer membrane using bioluminescence resonance energy transfer
    Osamu Sasaki; Takuma Yoshizumi; Misa Kuboyama; Takeshi Ishihara; Emiko Suzuki; Shun-ichiro Kawabata; Takumi Koshiba
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH, May 2013, Refereed
    Last
  • Mitochondrial-mediated antiviral immunity
    Takumi Koshiba
    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH, Jan. 2013, Refereed
    Lead
  • Fis1 acts as a mitochondrial recruitment factor for TBC1D15 that is involved in regulation of mitochondrial morphology
    Kenta Onoue; Akihiro Jofuku; Reiko Ban-Ishihara; Takaya Ishihara; Maki Maeda; Takumi Koshiba; Takashi Itoh; Mitsunori Fukuda; Hidenori Otera; Toshihiko Oka; Hiroyoshi Takano; Noboru Mizushima; Katsuyoshi Mihara; Naotada Ishihara
    Journal of Cell Science, 01 Jan. 2013, Refereed
  • Mitochondrial Membrane Potential Is Required for MAVS-Mediated Antiviral Signaling
    Takumi Koshiba; Kai Yasukawa; Yusuke Yanagi; Shun-ichiro Kawabata
    SCIENCE SIGNALING, Feb. 2011, Refereed
    Lead
  • Structure-Function Analysis of the Yeast Mitochondrial Rho GTPase, Gem1p
    Takumi Koshiba; Holly A. Holman; Kenji Kubara; Kai Yasukawa; Shun-ichiro Kawabata; Koji Okamoto; Jane Macfarlane; Janet M. Shaw
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Jan. 2011, Refereed
    Lead
  • Regulation of antiviral immunity on the mitochondrial outer membrane
    Takumi Koshiba
    Seikagaku, 2010, Refereed
  • Mitofusin 2 Inhibits Mitochondrial Antiviral Signaling
    Kai Yasukawa; Hiroyuki Oshiumi; Makoto Takeda; Naotada Ishihara; Yusuke Yanagi; Tsukasa Seya; Shun-ichiro Kawabata; Takumi Koshiba
    SCIENCE SIGNALING, Aug. 2009, Refereed
    Last
  • A structural perspective on the interaction between lipopolysaccharide and Factor C, a receptor involved in recognition of Gram-negative bacteria
    Takumi Koshiba; Tornoyuki Hashii; Shun-ichiro Kawabata
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2007, Refereed
    Lead
  • Crystallization of a 2 : 2 complex of granulocyte-colony stimulating factor (GCSF) with the ligand-binding region of the GCSF receptor
    E Honjo; T Tamada; Y Maeda; T Koshiba; Y Matsukura; T Okamoto; M Ishibashi; M Tokunaga; R Kuroki
    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, Aug. 2005, Refereed
  • Structural basis of mitochondrial tethering by mitofusin complexes
    T Koshiba; SA Detmer; JT Kaiser; HC Chen; JM McCaffery; DC Chan
    SCIENCE, Aug. 2004, Refereed
    Lead
  • Thermodynamic analysis of the activation mechanism of the GCSF receptor induced by ligand binding
    S Mine; T Koshiba; E Honjo; T Okamoto; T Tamada; Y Maeda; Y Matsukura; A Horie; M Ishibashi; M Sato; M Azuma; M Tokunaga; K Nitta; R Kuroki
    BIOCHEMISTRY, Mar. 2004, Refereed
  • The prefusogenic intermediate of HIV-1 gp41 contains exposed C-peptide regions
    T Koshiba; DC Chan
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, Feb. 2003, Refereed
    Lead
■ MISC
  • 炎症制御におけるミトコンドリアの新規機能の解明
    実験医学, 2023
    Last
  • ミトコンドリアの多面的な機能発現に関わるプロヒビチン複合体構造の解析
    錦織充広; 玉田太郎; 小柴琢己
    日本生化学会大会(Web), 2022
  • 自然免疫応答におけるミトコンドリアの役割
    医学のあゆみ, 2022
    Last
  • ミトコンドリア機能の調節に関わるプロヒビチン複合体の解析
    ミトコンドリアダイナミクス ~機能研究から疾患・老化まで~, 2021
    Last
  • ミトコンドリアと免疫機能
    FOOD Style 21, 2021
    Last
  • 抗ウイルス自然免疫におけるミトコンドリアの応答ゾーン
    福岡医誌, 2020, Refereed
    Last
  • プロテオミクスによるミトコンドリアタンパク質複合体の解析
    生物物理, 2020, Refereed
    Lead
  • ミトコンドリアと抗ウイルス自然免疫シグナル
    実験医学, 2019
    Corresponding
  • ミトコンドリアを介した自然免疫応答
    医学のあゆみ, 2018
    Corresponding
  • インフルエンザウイルス感染に伴うミトコンドリア形態への影響
    感染・炎症・免疫, 2017
    Corresponding
  • 蛍光ATPプローブによるミトコンドリア呼吸活性の評価
    KOSHIBA Takumi; IMAMURA Hiromi
    Seibutsu Butsuri, 2017, Refereed
    Lead
  • ミトコンドリア・ダイナミクスと抗ウイルス自然免疫
    細胞, 2016
    Corresponding
  • ウイルスタンパク質とミトコンドリアとの相互作用
    吉住 拓馬; 安川 開; 小柴 琢己
    福岡医誌, 2016, Refereed
    Lead
  • A型インフルエンザウイルスタンパク質PB1-F2とミトコンドリアとの相互作用
    吉住 拓馬; 小柴 琢己
    生化学, 2015, Refereed
    Last
  • 抗ウイルス自然免疫におけるミトコンドリアの役割
    細胞工学, 2015
    Corresponding
  • ウイルス自然免疫におけるミトコンドリアの生理的意義の解析
    薬学研究の進歩, 2014, Refereed
    Corresponding
  • 生体発光共鳴エネルギー転移を用いた生細胞内でのミトコンリアタンパク質間相互作用解析
    生物物理, 2014, Refereed
    Last
  • ミトコンドリアと抗ウイルス免疫
    生化学, 2013
    Corresponding
  • ミトコンドリア膜電位と抗ウイルス自然免疫
    実験医学, 2011
    Corresponding
  • 細胞内におけるミトコンドリアの形態調節ならびに抗ウイルス免疫応答
    KOSHIBA Takumi; KUBOYAMA Misa
    Seibutsu Butsuri, 2011, Refereed
    Lead
  • ミトコンドリア外膜タンパク質Mitofusin 2によるウイルス免疫制御機構
    実験医学, 2010
    Corresponding
  • ミトコンドリア外膜上でのウイルス免疫制御機構
    生化学, 2010, Refereed
    Corresponding
■ Lectures, oral presentations, etc.
  • MicroRNAs target mitochondrial-mediated antiviral innate immunity by regulating mitochondrial dynamics and metabolic demand
    MitoClub Seminars 2024 at the Max-Planck-Institute for Biology of Ageing, Feb. 2024
  • Mitochondrial-mediated antiviral innate immunity in mammals
    University of Ulsan - Fukuoka University International Joint Symposium, Aug. 2023
  • 病原体と宿主ミトコンドリアとの相互作用
    第13回 トランスポーター研究会(九州部会), Aug. 2023
  • Mitochondria and parasite interactions
    第45回 日本分子生物学会年会, Dec. 2022
  • ノンコーディングRNAによるミトコンドリア動態・代謝の調節
    第20回 ミトコンドリア学会年会, Dec. 2021
  • 質量分析法によるミトコンドリアタンパク質複合体の解析
    第59回 日本生物物理学会年会, Nov. 2021
  • miRNAを介したミトコンドリアの機能制御
    第93回 日本生化学会大会, Sep. 2020
  • ミトコンドリアを介した抗ウイルス自然免疫
    第42回 日本分子生物学会年会, Dec. 2019
  • Structural basis of mitochondrial scaffolds by prohibitin complexes
    The 16th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research and Medicine, Oct. 2019
  • ミトコンドリアにおける自然免疫応答ゾーンの解析
    第92回 日本生化学会大会, Sep. 2019
  • Structure-function analysis of the prohibitin complexes in mitochondria
    第71回 日本細胞生物学会大会, Jun. 2019
  • Mitochondrial-mediated antiviral innate immunity in mammals
    The 15th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research and Medicine, Nov. 2018
  • Mitochondrial-mediated antiviral innate immunity in mammals
    The 3rd Asian Invertebrate Immunity Symposium 2018, Sep. 2018
  • Mitochondrial respiration and MAVS-mediated antiviral innate immunity
    International Symposium on "Molecular Basis of Virus-Host Interactions", Oct. 2016
  • Mitochondrial-mediated antiviral innate immunity and oxidative phosphorylation
    The 13th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research and Medicine, Oct. 2016
  • Influenza A viral protein PB1-F2 and mitochondria
    The 5th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology, Apr. 2015
  • Mitochondria and antiviral signaling
    The 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria, Oct. 2013
  • MAVS signaling and its inhibition
    International Endotoxin and Innate Immunity Society Meeting 2012, Oct. 2012
  • Mitochondrial membrane potential is required for MAVS-mediated antiviral signaling
    Mitochondria Dynamics: from Mechanism to Disease, Sep. 2011
■ Courses
  • 生物物理化学
    福岡大学
  • 分子生物学
    九州大学
  • 生物物理学
    九州大学
  • Biochemistry
    Fukuoka University
  • 自然界と物質の化学
    福岡大学
  • 化学D
    福岡大学
  • 化学C
    福岡大学
■ Affiliated academic society
  • THE JAPANESE SOCIETY OF MITOCHONDRIAL RESEARCH AND MEDICINE
  • THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN
  • THE JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY
  • THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
■ Research Themes
  • ミトコンドリア・ダイナミクスを介したストレス応答機構の解明
    日本学術振興会, 科学研究費補助金, 基盤研究(B)(一般)
    2023 - 2027
  • イムノコンドリア:自然免疫における中枢機能の解明
    Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    Fukuoka University
    2021 - 2024
  • ミトコンドリア内における自然免疫応答ゾーンの探索的研究
    文部科学省, 科学研究費補助金, 新学術領域研究(公募研究)
    2020 - 2022
  • ミトコンドリアにおける自然免疫応答ゾーンの解析
    文部科学省, 科学研究費補助金, 新学術領域研究(公募研究)
    2018 - 2020
  • ミトコンドリア・ダイナミクスの分子機構の解明と高次生理機能の考察
    日本学術振興会, 科学研究費補助金, 基盤研究(B)(一般)
    2017 - 2020
  • ミトコンドリアの動的な構造特性の改変;抗ウイルス自然免疫への影響
    日本学術振興会, 科学研究費補助金, 挑戦的研究(萌芽)
    2017 - 2019
  • ウイルスタンパク質とミトコンドリアとの相互作用解析
    文部科学省, 科学研究費補助金, 新学術領域研究(公募研究)
    2015 - 2017
  • 哺乳動物におけるミトコンドリア・ダイナミクスの分子基盤解析
    日本学術振興会, 科学研究費補助金, 基盤研究(B)(一般)
    2014 - 2017
  • 細胞内でのミトコンドリアの動きには酵素活性が必要なのか?
    日本学術振興会, 科学研究費補助金, 挑戦的萌芽研究
    2014 - 2016
  • ミトコンドリア・宿主間コミュニケーションによる抗ウイルス免疫機構の解析
    文部科学省, 科学研究費補助金, 新学術領域研究(公募研究)
    2013 - 2015
  • ミトコンドリアタンパク質を介した抗ウイルス自然免疫の構造生物学的研究
    日本学術振興会, 科学研究費補助金, 若手研究(B)
    2012 - 2014
  • ミトコンドリア蛋白質の生体防御反応における役割解明
    Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B), Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    Kyushu University
    2008 - 2009
  • リポ多糖認識に伴う生体膜融合及び分泌機構の分子基盤解析
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 若手研究(B)
    九州大学
    2006 - 2007
  • カルシウム結合タンパク質の構造生物学的及びタンパク質工学的研究
    日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 特別研究員奨励費
    北海道大学
    2000 - 2000
■ Social Contribution Activities
  • ダイナミックに動く!「新・ミトコンドリア」の実像
    lecturer
    フロムページ, 夢ナビライブ, Aug. 2023
■ Media Coverage
  • インフルで免疫低下 解明
    西日本新聞, Aug. 2014, Paper
  • インフル悪化の仕組み解明
    産経新聞, Aug. 2014, Paper
  • インフル感染で免疫低下
    日本経済新聞, Aug. 2014, Paper