Jul. 2023
自然科学研究機構, 若手研究者賞

Neofunctionalization of VAMP7 opened up a plant-unique vacuolar transport pathway
Masaru Fujimoto; Yutaro Shimizu; Yoko Ito; Kazuo Ebine; Naoki Minamino; Takehiko Kanazawa; Yoichiro Fukao; Akihiko Nakano; Tomohiro Uemura; Takashi Ueda
Current Biology, May 2025, Refereed

A non-canonical BZR/BES transcription factor regulates the development of haploid reproductive organs in Marchantia polymorpha.
Tomoyuki Furuya; Natsumi Saegusa; Shohei Yamaoka; Yuki Tomoita; Naoki Minamino; Masaki Niwa; Keisuke Inoue; Chiaki Yamamoto; Kazuki Motomura; Shunji Shimadzu; Ryuichi Nishihama; Kimitsune Ishizaki; Takashi Ueda; Hidehiro Fukaki; Takayuki Kohchi; Hiroo Fukuda; Masahiro Kasahara; Takashi Araki; Yuki Kondo
Nature plants, 11 Apr. 2024

The sperm nuclear basic proteins of the sword fern (Polystichum munitum)
Juan Ausio; Alistair Knox; Bo-Hyun Kim; Elaine Humphrey; Brent Gowen; Naoki Minamino; Patrick von Aderkas
Biochemistry and Cell Biology, 12 Feb. 2024, Refereed

Comprehensive and quantitative analysis of intracellular structure polarization at the apical–basal axis in elongating Arabidopsis zygotes
Yukiko Hiromoto; Naoki Minamino; Suzuka Kikuchi; Yusuke Kimata; Hikari Matsumoto; Sakumi Nakagawa; Minako Ueda; Takumi Higaki
Scientific Reports, 18 Dec. 2023, 13(1), Refereed

Analysis of plant-specific ANTH domain-containing protein in Marchantia polymorpha
Naoki Minamino; Haruki Fujii; Haruhiko Murata; Sho Hachinoda; Yohei Kondo; Kazuhiro Hotta; Takashi Ueda
Plant And Cell Physiology, 07 Oct. 2023, Refereed
Lead

Harnessing Deep Learning to Analyze Cryptic Morphological Variability of Marchantia polymorpha.
Yoko Tomizawa; Naoki Minamino; Eita Shimokawa; Shogo Kawamura; Aino Komatsu; Takuma Hiwatashi; Ryuichi Nishihama; Takashi Ueda; Takayuki Kohchi; Yohei Kondo
Plant And Cell Physiology, 05 Oct. 2023, Refereed

Autophagy regulates plastid reorganization during spermatogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha
Takuya Norizuki; Naoki Minamino; Miyuki Sato; Takashi Ueda
Frontiers in Plant Science, 09 Feb. 2023, 14, Refereed

Remodeling of organelles and microtubules during spermiogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha.
Naoki Minamino; Takuya Norizuki; Shoji Mano; Kazuo Ebine; Takashi Ueda
Development (Cambridge, England), 01 Aug. 2022, 149(15), Refereed
Lead

Phylogenetic distribution and expression pattern analyses identified a divergent basal body assembly protein involved in land plant spermatogenesis.
Shizuka Koshimizu; Naoki Minamino; Tomoaki Nishiyama; Emiko Yoro; Mayuko Sato; Mayumi Wakazaki; Kiminori Toyooka; Kazuo Ebine; Keiko Sakakibara; Takashi Ueda; Kentaro Yano
The New phytologist, 16 Jul. 2022, 236(3):1182 - 1196, Refereed
Lead

Dynamic rearrangement and autophagic degradation of mitochondria during spermiogenesis in the liverwort Marchantia polymorpha.
Takuya Norizuki; Naoki Minamino; Miyuki Sato; Hirokazu Tsukaya; Takashi Ueda
Cell reports, 14 Jun. 2022, 39(11):110975 - 110975, Refereed

Membrane trafficking functions of the ANTH/ENTH/VHS domain-containing proteins in plants.
Yihong Feng; Takuma Hiwatashi; Naoki Minamino; Kazuo Ebine; Takashi Ueda
FEBS letters, 03 May 2022, Refereed

Classification and Analysis of Liverwort Sperm by Integration-Net.
Haruki Fujii; Naoki Minamino; Takashi Ueda; Yohei Kondo; Kazuhiro Hotta
Proceedings of the 17th International Joint Conference on Computer Vision, Imaging and Computer Graphics Theory and Applications, 2022, :699 - 705

The liverwort oil body is formed by redirection of the secretory pathway.
Takehiko Kanazawa; Hatsune Morinaka; Kazuo Ebine; Takashi L Shimada; Sakiko Ishida; Naoki Minamino; Katsushi Yamaguchi; Shuji Shigenobu; Takayuki Kohchi; Akihiko Nakano; Takashi Ueda
Nature communications, 01 Dec. 2020, 11(1):6152 - 6152, Refereed

Role of Autophagy in Male Reproductive Processes in Land Plants
Takuya Norizuki; Naoki Minamino; Takashi Ueda
Frontiers in Plant Science, 17 Jun. 2020, 11:756 - 756, Refereed

Protamines from liverwort are produced by post-translational cleavage and C-terminal di-aminopropanelation of several male germ-specific H1 histones
Robert Anthony D'Ippolito; Naoki Minamino; Ciro Rivera-Casas; Manjinder S. Cheema; Dina L. Bai; Harold E. Kasinsky; Jeffrey Shabanowitz; Jose M. Eirin-Lopez; Takashi Ueda; Donald F. Hunt; Juan Ausio
Journal of Biological Chemistry, Nov. 2019, 294(44):16364 - 16373, Refereed

The RopGEF KARAPPO Is Essential for the Initiation of Vegetative Reproduction in Marchantia polymorpha
Hiwatashi, T.; Goh, H.; Yasui, Y.; Koh, L.Q.; Takami, H.; Kajikawa, M.; Kirita, H.; Kanazawa, T.; Minamino, N.; Togawa, T.; Sato, M.; Wakazaki, M.; Yamaguchi, K.; Shigenobu, S.; Fukaki, H.; Mimura, T.; Toyooka, K.; Sawa, S.; Yamato, K.T.; Ueda, T.; Urano, D.; Kohchi, T.; Ishizaki, K.
Current Biology, 2019, 29(20):3525 - 3531, Refereed

Marchantia polymorpha, a new model plant for autophagy studies
Norizuki, T.; Kanazawa, T.; Minamino, N.; Tsukaya, H.; Ueda, T.
Frontiers in Plant Science, 2019, 10:935 - 935, Refereed

RAB GTPases and their effectors in plant endosomal transport
Minamino, N.; Ueda, T.
Current Opinion in Plant Biology, 2019, 52:61 - 68, Refereed
Lead

RAB GTPases in the Basal Land Plant Marchantia polymorpha
Minamino, N.; Kanazawa, T.; Era, A.; Ebine, K.; Nakano, A.; Ueda, T.
Plant and Cell Physiology, 2018, 59(4):845 - 856, Refereed
Lead

Insights into Land Plant Evolution Garnered from the Marchantia polymorpha Genome
Bowman, J.L.; Kohchi, T.; Yamato, K.T.; Jenkins, J.; Shu, S.; Ishizaki, K.; Yamaoka, S.; Nishihama, R.; Nakamura, Y.; Berger, F.; Adam, C.; Aki, S.S.; Althoff, F.; Araki, T.; Arteaga-Vazquez, M.A.; Balasubrmanian, S.; Barry, K.; Bauer, D.; Boehm, C.R.; Briginshaw, L.; Caballero-Perez, J.; Catarino, B.; Chen, F.; Chiyoda, S.; Chovatia, M.; Davies, K.M.; Delmans, M.; Demura, T.; Dierschke, T.; Dolan, L.; Dorantes-Acosta, A.E.; Eklund, D.M.; Florent, S.N.; Flores-Sandoval, E.; Fujiyama, A.; Fukuzawa, H.; Galik, B.; Grimanelli, D.; Grimwood, J.; Grossniklaus, U.; Hamada, T.; Haseloff, J.; Hetherington, A.J.; Higo, A.; Hirakawa, Y.; Hundley, H.N.; Ikeda, Y.; Inoue, K.; Inoue, S.-I.; Ishida, S.; Jia, Q.; Kakita, M.; Kanazawa, T.; Kawai, Y.; Kawashima, T.; Kennedy, M.; Kinose, K.; Kinoshita, T.; Kohara, Y.; Koide, E.; Komatsu, K.; Kopischke, S.; Kubo, M.; Kyozuka, J.; Lagercrantz, U.; Lin, S.-S.; Lindquist, E.; Lipzen, A.M.; Lu, C.-W.; De Luna, E.; Martienssen, R.A.; Minamino, N.; Mizutani, M.; Mizutani, M.; Mochizuki, N.; Monte, I.; Mosher, R.; Nagasaki, H.; Nakagami, H.; Naramoto, S.; Nishitani, K.; Ohtani, M.; Okamoto, T.; Okumura, M.; Phillips, J.; Pollak, B.; Reinders, A.; Rövekamp, M.; Sano, R.; Sawa, S.; Schmid, M.W.; Shirakawa, M.; Solano, R.; Spunde, A.; Suetsugu, N.; Sugano, S.; Sugiyama, A.; Sun, R.; Suzuki, Y.; Takenaka, M.; Takezawa, D.; Tomogane, H.; Tsuzuki, M.; Ueda, T.; Umeda, M.; Ward, J.M.; Watanabe, Y.; Yazaki, K.; Yokoyama, R.; Yoshitake, Y.; Yotsui, I.; Zachgo, S.; Schmutz, J.
Cell, 2017, 171(2):287 - 304, Refereed

Dynamic reorganization of the endomembrane system during spermatogenesis in Marchantia polymorpha
Minamino, N.; Kanazawa, T.; Nishihama, R.; Yamato, K.T.; Ishizaki, K.; Kohchi, T.; Nakano, A.; Ueda, T.
Journal of Plant Research, 2017, 130(3):433 - 441, Refereed
Lead

SNARE molecules in Marchantia polymorpha: Unique and conserved features of the membrane fusion machinery
Kanazawa, T.; Era, A.; Minamino, N.; Shikano, Y.; Fujimoto, M.; Uemura, T.; Nishihama, R.; Yamato, K.T.; Ishizaki, K.; Nishiyama, T.; Kohchi, T.; Nakano, A.; Ueda, T.
Plant and Cell Physiology, 2016, 57(2):307 - 324, Refereed

ゼニゴケ有性生殖におけるGEX1ホモログの機能解析
永塚さくら; 山岡尚平; 南野尚紀; 上田貴志; 西川周一
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2023, 46th

深層学習の植物画像解析への応用
Mar. 2022, 6(3):242 - 247

ゼニゴケの精子形成に関わる膜交通因子の解析
南野尚紀; 金澤建彦; 法月拓也; 石田咲子; 西浜竜一; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2018, 82nd:153

動植物の精子変態過程におけるオートファジーの役割
法月 拓也; 南野 尚紀; 上田 貴志
植物科学の最前線, 2018, 9(A):17 - 28

ゼニゴケの精子変態過程におけるオートファジーを介したオルガネラリモデリングの解析
法月拓也; 南野尚紀; 金澤建彦; 真野昌二; 西浜竜一; 河内孝之; 上田貴志
日本植物生理学会年会(Web), 2018, 59th:ROMBUNNO.2aD05

ゼニゴケRAB21の機能解析
南野尚紀; 金澤建彦; 西浜竜一; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物生理学会年会(Web), 2018, 59th:ROMBUNNO.3aF10

ゼニゴケのSNARE分子から観る膜融合装置の保存性と多様性
金澤建彦; 恵良厚子; 南野尚紀; 鹿野悠; 藤本優; 植村知博; 西浜竜一; 大和勝幸; 石崎公庸; 西山智明; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2015, 79th:163

基部陸上植物ゼニゴケにおけるRAB GTPaseの網羅的解析
南野尚紀; 金澤建彦; 恵良厚子; 西浜竜一; 大和勝幸; 石崎公庸; 西山智明; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物生理学会年会要旨集, 09 Mar. 2015, 56th:160

基部陸上植物ゼニゴケにおける膜交通因子の網羅的解析
南野尚紀; 金澤建彦; 恵良厚子; 石崎公庸; 西浜竜一; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物学会大会研究発表記録, 01 Sep. 2014, 78th:233

ゼニゴケRAB21の機能とその進化的意義の解析
南野尚紀; 恵良厚子; 金澤建彦; 砂田麻里子; 西山智明; 西浜竜一; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物生理学会年会要旨集, 11 Mar. 2014, 55th:198

ゼニゴケRAB21ホモログの機能と進化的意義の解析
南野尚紀; 恵良厚子; 砂田麻里子; 西山智明; 西浜竜一; 河内孝之; 中野明彦; 上田貴志
日本植物学会大会研究発表記録, 20 Aug. 2013, 77th:140

イメージング・AI技術を駆使して植物精子の形成と運動の仕組みを理解する
南野尚紀; 法月拓也; 藤井春樹; 八野田奨; 海老根一生; 真野昌二; 堀田一弘; 上田貴志
日本植物学会第86回大会

Membrane traffic in spermatogenesis of Marchantia polymorpha
Minamino, N; Kanazawa, T; Era, A; Nishihama, R; Yamato, K.T; Ishizaki, K; Kohchi, T; Nakano, A; Ueda, T
The 79th Annual Meeting of the Botanical Society of Japan

Japan Society for Cell Biology

The Japanese Society of Plant Physiologists

The Botanical Society of Japan

ゼニゴケ精子変態期における細胞骨格系の役割の解明
日本学術振興会, 科学研究費助成事業, 基盤研究(C)
熊本大学
01 Apr. 2024 - 31 Mar. 2027

ゼニゴケ精子変態期のライブイメージング手法の確立と細胞内分解系の役割の解明
日本学術振興会, 科学研究費助成事業 若手研究, 若手研究
基礎生物学研究所
01 Apr. 2022 - 31 Mar. 2024

RAB23が関わる植物精子の運動装置形成機構の解明
日本学術振興会, 科学研究費助成事業 若手研究, 若手研究
基礎生物学研究所
01 Apr. 2020 - 31 Mar. 2022

ゼニゴケの精子形成と鞭毛機能におけるＲＡＢ ＧＴＰａｓｅの役割の解析
日本学術振興会, 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費, 特別研究員奨励費
東京大学
22 Apr. 2016 - 31 Mar. 2018